MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 22979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022107	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_022107	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022107	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022107	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022107	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022107	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022107	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022107	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022107	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022107	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022107	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022107	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022107	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022107	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_022107	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022107	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022107	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022107	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022107	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022107	CCT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_022107	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022107	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022107	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022107	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022107	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022107	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022107	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022107	T	7	7	1247	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022107	A	6	6	1258	1263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022107	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022107	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350435
32	NC_022107	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350435
33	NC_022107	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350435
34	NC_022107	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350435
35	NC_022107	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	532350435
36	NC_022107	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350435
37	NC_022107	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350435
38	NC_022107	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350435
39	NC_022107	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350435
40	NC_022107	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	532350435
41	NC_022107	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350435
42	NC_022107	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350435
43	NC_022107	T	6	6	1639	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022107	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022107	T	7	7	1661	1667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022107	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022107	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022107	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350436
49	NC_022107	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350436
50	NC_022107	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350436
51	NC_022107	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	532350436
52	NC_022107	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	532350436
53	NC_022107	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350436
54	NC_022107	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350436
55	NC_022107	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350436
56	NC_022107	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350436
57	NC_022107	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	532350437
58	NC_022107	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350437
59	NC_022107	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	532350437
60	NC_022107	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350437
61	NC_022107	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350437
62	NC_022107	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350437
63	NC_022107	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350437
64	NC_022107	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350437
65	NC_022107	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350437
66	NC_022107	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350437
67	NC_022107	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350437
68	NC_022107	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350437
69	NC_022107	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350437
70	NC_022107	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	532350437
71	NC_022107	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	532350437
72	NC_022107	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350437
73	NC_022107	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350437
74	NC_022107	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350437
75	NC_022107	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	532350437
76	NC_022107	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350437
77	NC_022107	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350437
78	NC_022107	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350437
79	NC_022107	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350437
80	NC_022107	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	532350437
81	NC_022107	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	532350437
82	NC_022107	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350437
83	NC_022107	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350437
84	NC_022107	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350437
85	NC_022107	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350437
86	NC_022107	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	532350438
87	NC_022107	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350438
88	NC_022107	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350438
89	NC_022107	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	532350438
90	NC_022107	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350438
91	NC_022107	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	532350438
92	NC_022107	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350438
93	NC_022107	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	532350438
94	NC_022107	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350438
95	NC_022107	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350438
96	NC_022107	A	7	7	4328	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	532350438
97	NC_022107	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350438
98	NC_022107	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	532350438
99	NC_022107	A	7	7	4374	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	532350438
100	NC_022107	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350438
101	NC_022107	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	532350438
102	NC_022107	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	532350438
103	NC_022107	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350438
104	NC_022107	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350438
105	NC_022107	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350438
106	NC_022107	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350438
107	NC_022107	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350438
108	NC_022107	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	532350438
109	NC_022107	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350438
110	NC_022107	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532350438
111	NC_022107	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	532350438
112	NC_022107	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350438
113	NC_022107	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350438
114	NC_022107	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022107	A	6	6	5066	5071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022107	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022107	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350439
118	NC_022107	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350439
119	NC_022107	GCT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350439
120	NC_022107	GTCTT	2	10	5217	5226	0 %	60 %	20 %	20 %	532350439
121	NC_022107	GAT	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350439
122	NC_022107	TC	3	6	5262	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	532350439
123	NC_022107	GA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	532350439
124	NC_022107	ACG	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350439
125	NC_022107	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350439
126	NC_022107	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	532350439
127	NC_022107	AT	3	6	5377	5382	50 %	50 %	0 %	0 %	532350439
128	NC_022107	AGA	3	9	5385	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350439
129	NC_022107	GCT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350439
130	NC_022107	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350439
131	NC_022107	TGG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350439
132	NC_022107	AGA	3	9	5457	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350439
133	NC_022107	GGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350439
134	NC_022107	TG	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	532350439
135	NC_022107	T	6	6	5608	5613	0 %	100 %	0 %	0 %	532350439
136	NC_022107	TCA	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350439
137	NC_022107	GGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350439
138	NC_022107	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	532350439
139	NC_022107	CTT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350439
140	NC_022107	CTG	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350439
141	NC_022107	CAG	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350439
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143	NC_022107	GCA	2	6	5947	5952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350439
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146	NC_022107	GGAG	2	8	6304	6311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022107	CTT	2	6	6360	6365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_022107	AG	3	6	6412	6417	50 %	0 %	50 %	0 %	532350440
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152	NC_022107	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	532350440
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157	NC_022107	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022107	A	6	6	7011	7016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022107	TATTT	2	10	7032	7041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022107	ATTT	2	8	7094	7101	25 %	75 %	0 %	0 %	532351272
161	NC_022107	TTA	2	6	7152	7157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351272
162	NC_022107	ATTT	2	8	7185	7192	25 %	75 %	0 %	0 %	532351272
163	NC_022107	GAA	2	6	7201	7206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351272
164	NC_022107	ATG	2	6	7237	7242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022107	TCG	2	6	7314	7319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350441
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167	NC_022107	GTT	2	6	7465	7470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350441
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173	NC_022107	A	6	6	7967	7972	100 %	0 %	0 %	0 %	532350441
174	NC_022107	T	6	6	8052	8057	0 %	100 %	0 %	0 %	532350441
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179	NC_022107	ACC	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350442
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206	NC_022107	TATT	2	8	9309	9316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
207	NC_022107	CCT	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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258	NC_022107	TA	3	6	11249	11254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_022107	TCA	2	6	11280	11285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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268	NC_022107	ACA	2	6	11613	11618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350445
269	NC_022107	TAG	2	6	11712	11717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350445
270	NC_022107	AAGAA	2	10	11805	11814	80 %	0 %	20 %	0 %	532350445
271	NC_022107	A	6	6	11820	11825	100 %	0 %	0 %	0 %	532350445
272	NC_022107	TA	3	6	11870	11875	50 %	50 %	0 %	0 %	532350445
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274	NC_022107	TAC	2	6	11906	11911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350445
275	NC_022107	TCA	2	6	11913	11918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350445
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283	NC_022107	ATA	2	6	12474	12479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350445
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391	NC_022107	GTT	2	6	17631	17636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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404	NC_022107	AGA	2	6	18272	18277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350450
405	NC_022107	AGA	2	6	18377	18382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
406	NC_022107	AAT	3	9	18439	18447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350451
407	NC_022107	CT	3	6	18451	18456	0 %	50 %	0 %	50 %	532350451
408	NC_022107	TCT	2	6	18467	18472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350451
409	NC_022107	TGCG	2	8	18527	18534	0 %	25 %	50 %	25 %	532350451
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413	NC_022107	GA	3	6	18765	18770	50 %	0 %	50 %	0 %	532350451
414	NC_022107	ACT	2	6	18777	18782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350451
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432	NC_022107	TTTG	2	8	19537	19544	0 %	75 %	25 %	0 %	532350451
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438	NC_022107	AAT	2	6	19796	19801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350451
439	NC_022107	AAG	2	6	19839	19844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350451
440	NC_022107	CTT	3	9	19893	19901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_022107	T	6	6	19900	19905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_022107	T	6	6	19907	19912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_022107	GGA	2	6	20612	20617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_022107	GA	3	6	20675	20680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
462	NC_022107	TGG	2	6	20871	20876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_022107	GTTA	2	8	21327	21334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
473	NC_022107	GATC	2	8	21382	21389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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486	NC_022107	TCT	2	6	22080	22085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350453
487	NC_022107	AT	3	6	22188	22193	50 %	50 %	0 %	0 %	532350453
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500	NC_022107	TTG	2	6	22974	22979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350453

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